东北师范大学环境工程研究中心隶属于东北师范大学环境学院。1999年，为迎合国家环境保护战略，促进我校环境专业发展，在原环境工程系的基础上成立了环境工程研究中心。2002年正式招收环境工程硕士研究生，2008年开始招收环境工程博士研究生，2014年开始招收环境工程专业本科生。中心经过近20年的发展，现有正式工作人员16人，其中教授5人，副教授5人，讲师3人，工程师3人。

中心立足于吉林省，依托东北师范大学环境学院，主要从事废水、给水、废气、固废等环境问题的理论研究及工程转化工作。中心以城市污（废）水、废气、固废处理及资源化技术发展前沿和我省重大环境战略需求为导向，以创建省内领先，国内知名，具有特色的高水平实验室为目标，在再生水地下储存的水质调控原理与工程技术、城市污水深度处理技术与工程示范、饮用水水质安全控制技术与成套设备、工业废水处理技术与工程应用、工业废气处理技术与工程应用、城市餐厨垃圾处理技术与成套设备等方向开展基础研究及工程技术研究。中心致力于集聚和培养一批高水平的创新型人才，建设在省内一流，国内知名的基础性、跨学科、开放式的环境工程研究机构。

中心拥有实验室约3000余平米，中心下设水质工程学、大气污染控制、固废处理及资源化等6个实验室，再生水处理、工业废气处理、固废资源化等5个工作室，并与省内企事业单位合作建立了14个实习基地。根据实验室发展需求，中心先后购置气相色谱仪，液相色谱仪等精密检测设备，设备总价值超2500万元。